Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRTO4Q9UKD2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRTO4Q9UKD2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms