Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNL1Q9UK58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNL1Q9UK58 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNL1Q9UK58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms