Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBE1Q9UJT0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms