Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO3A1Q9UIG8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO3A1Q9UIG8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms