Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPS1Q9UHF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPS1Q9UHF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPS1Q9UHF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms