Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN2A-AS1Q9UH64 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms