Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEPT3Q9UH03 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEPT3Q9UH03 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms