Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC6Q9UBN7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms