Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGC1AQ9UBK2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms