Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAE1Q9UBE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms