Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ORC3Q9UBD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ORC3Q9UBD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms