Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL13Q9P2N7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms