Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHPF2Q9P2E5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHPF2Q9P2E5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms