Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSKIPQ9P0R6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GSKIPQ9P0R6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms