Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms