Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP1Q9NZI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP1Q9NZI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms