Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL3Q9NYJ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DLL3Q9NYJ7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms