Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSD3Q9NYI0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms