Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A12Q9NXJ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms