Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD4Q9NXE4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD4Q9NXE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms