Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3EQ9NVU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3EQ9NVU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3EQ9NVU0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms