Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF19AQ9NV58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF19AQ9NV58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF19AQ9NV58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms