Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB4Q9NTQ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB4Q9NTQ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms