Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMSN1Q9NSI8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms