Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOPORSQ9NS56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms