Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms