Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGAP35Q9NRY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ARHGAP35Q9NRY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGAP35Q9NRY4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms