Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHPT1Q9NRX4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms