Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.91e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.831e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.791e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.691e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.41e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 525.66■■□□□ 1.71e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 433.72■■■□□ 2.991e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 428.27■■■□□ 2.121e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 238.72■■■■□ 3.794e-10■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 219.54■□□□□ 0.721e-9■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 335.96■■■■□ 3.352e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 235.54■■■■□ 3.282e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 333.01■■■□□ 2.882e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 332.95■■■□□ 2.862e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.332e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 427.63■■■□□ 2.012e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.872e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 225.56■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 223.98■■□□□ 1.432e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DBN1-204ENST00000467054 793 ntTSL 221.5■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.824e-8■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 DUSP9-203ENST00000477033 430 ntTSL 330.72■■■□□ 2.514e-8■■■■■ 28.3
DROSHAQ9NRR4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.733e-7■■■■■ 28.2
DROSHAQ9NRR4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.613e-7■■■■■ 28.2
DROSHAQ9NRR4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 28.2
DROSHAQ9NRR4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.664e-6■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.724e-6■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MOB2-203ENST00000526698 608 ntTSL 331.6■■■□□ 2.654e-6■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MOB2-202ENST00000526462 795 ntTSL 219.95■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.565e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.365e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.35e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.754e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.754e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.434e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.385e-9■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SLC4A2-216ENST00000490898 702 ntTSL 325.44■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 530.86■■■□□ 2.533e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.53e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.333e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.23e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.153e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 523.62■■□□□ 1.373e-8■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.361e-13■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 335.28■■■■□ 3.247e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.157e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.677e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.367e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.667e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-208ENST00000634926 269 ntTSL 1 (best)3.5□□□□□ -1.857e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 SMARCB1-209ENST00000635578 242 ntTSL 1 (best)1.21□□□□□ -2.227e-16■■■■■ 28.1
DROSHAQ9NRR4 AL591895.1-201ENST00000424332 348 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 TMED2-202ENST00000438031 603 ntTSL 441.27■■■■■ 4.24e-12■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.14e-12■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-211ENST00000529643 660 ntTSL 331.55■■■□□ 2.643e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-206ENST00000525891 743 ntTSL 431.13■■■□□ 2.572e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.243e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.053e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-206ENST00000526242 474 ntTSL 427.7■■■□□ 2.023e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-207ENST00000526397 882 ntTSL 526.84■■□□□ 1.893e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 TMED2-204ENST00000543425 1350 ntTSL 320.52■□□□□ 0.884e-12■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 TMED2-205ENST00000544188 433 ntTSL 218.04■□□□□ 0.484e-12■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-203ENST00000525492 529 ntTSL 417.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 24e-6■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 331.55■■■□□ 2.648e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.275e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 227.57■■■□□ 25e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 526.12■■□□□ 1.775e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.775e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 224.86■■□□□ 1.576e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 224.66■■□□□ 1.545e-30■■■■■ 28
DROSHAQ9NRR4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.045e-7■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 326.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.785e-7■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 326.59■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 528.19■■■□□ 2.12e-24■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 526.22■■□□□ 1.792e-24■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 27.9
DROSHAQ9NRR4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.13e-17■■■■■ 27.8
DROSHAQ9NRR4 CHCHD2-202ENST00000473095 694 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.033e-17■■■■■ 27.8
DROSHAQ9NRR4 CHST15-203ENST00000462406 826 ntTSL 213.17□□□□□ -0.39e-9■■■■■ 27.8
DROSHAQ9NRR4 CHD9-208ENST00000563410 488 ntTSL 232.94■■■□□ 2.863e-10■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.943e-10■■■■■ 27.7
DROSHAQ9NRR4 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.533e-10■■■■■ 27.7
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