Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS2Q9NRF8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS2Q9NRF8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS2Q9NRF8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTPS2Q9NRF8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS2Q9NRF8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms