Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms