Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ASCL3Q9NQ33 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ASCL3Q9NQ33 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms