Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FZD3Q9NPG1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms