Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC4Q9NPD3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC4Q9NPD3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms