Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MID1IP1Q9NPA3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID1IP1Q9NPA3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms