Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA8Q9NP80 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA8Q9NP80 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA8Q9NP80 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms