Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB6Q9NP58 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB6Q9NP58 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB6Q9NP58 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms