Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf42Q9H799 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf42Q9H799 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf42Q9H799 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms