Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO44Q9H4M3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO44Q9H4M3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms