Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SENP3Q9H4L4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms