Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NXF3Q9H4D5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms