Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIPK3Q9H422 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms