Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms