Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2J2Q9GZM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms