Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THSD7BQ9C0I4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD7BQ9C0I4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms