Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LNPKQ9C0E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LNPKQ9C0E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LNPKQ9C0E8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms