Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INO80BQ9C086 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80BQ9C086 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms