Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCO2Q9BYV7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms