Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms