Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIFKQ9BYG3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIFKQ9BYG3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms